Орган Управління відповідає за управління програмою відповідно до принципу розумного фінансового управління та повинен переконатися в тому, що рішення Спільного Моніторингового Комітету прийняті відповідно до чинної нормативно-правової бази.
Міністерство регіонального розвитку, державного управління та європейських фондів було назначено цими двома країнами Органом Управління Спільною Операційною Програмою Румунія – Україна 2014-2020 рр.
Орган Управління надає виклики для проектів та в результаті процесу відбору укладає з бенефіціарами договори фінансування та здійснює моніторинг впровадження проектів.
Орган Управління забезпечує інформування бенефіціарів для належного впровадження проектів.