Спільний Моніторинговий Комітет складається з представників місцевих, регіональних та центральних органів влади, що беруть участь в програмі. Кожна країна-учасниця має рівні права голосу, незалежно від числа призначених представників.
Спільний Моніторинговий Комітет спостерігає за розгортанням програми, розглядає всі питання, що впливають на її продуктивність, маючи можливість видавати Органу Управління рекомендації щодо її впровадження. Роботи та рішення Спільного Моніторингового Комітету ґрунтуються на принципах прозорості, рівного ставлення, недискримінації, об’єктивності та чесної конкуренції.
Спільний Моніторинговий Комітет затверджує критерії відбору проектів та несе відповідальність за процедури оцінки та відбору, що застосовуються до проектів фінансованих в рамках програми.